На самом деле во временной регистрации для хозяина квартиры нет ничего страшного, особенно, если квартира сдается официально. Т.к. хозяин в любой момент может "выписать" жильцов по своему усмотрению. Согласие и присутствие жильцов не требуется.
А вот если выяснится, что квартира сдается неофициально, хозяину грозит приличный штраф.
Но даже при неофициальной сдаче часто оформляют договор безвозмездного проживания, с ним тоже ничего не мешает сделать регистрацию.
Но 90% собственников во-первых не хотят платить налоги и не оформляют сдачу квартиры официально, а во-вторых, не знают про временную регистрацию и боятся ее оформлять